Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930544D05RikJ3QK56 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930544D05RikJ3QK56 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms