Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zc3h12bG3X9I7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms