Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SmgcF6VRN1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SmgcF6VRN1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SmgcF6VRN1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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