Protein–RNA interactions for Protein: F6VLK5

Gm10722, Predicted gene 10722, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10722F6VLK5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10722F6VLK5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10722F6VLK5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10722F6VLK5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10722F6VLK5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10722F6VLK5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm10722F6VLK5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm10722F6VLK5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms