Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sptbn5F6UCX4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sptbn5F6UCX4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms