Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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