Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5415E9PXF3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm5415E9PXF3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms