Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PtprbB2RU80 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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