Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pramel3A2AHA7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms