Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm4T1NXB5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms