Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria4Q9Z2W8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gria4Q9Z2W8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms