Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mbd1Q9Z2E2 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mbd1Q9Z2E2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms