Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C4

Mtmr1, Myotubularin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr1Q9Z2C4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mtmr1Q9Z2C4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms