Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z108

Stau1, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stau1Q9Z108 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stau1Q9Z108 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stau1Q9Z108 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms