Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp1a4Q9WV27 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms