Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
VapbQ9QY76 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
VapbQ9QY76 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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