Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fscn3Q9QXW4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fscn3Q9QXW4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fscn3Q9QXW4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Fscn3Q9QXW4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Fscn3Q9QXW4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fscn3Q9QXW4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fscn3Q9QXW4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fscn3Q9QXW4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fscn3Q9QXW4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fscn3Q9QXW4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fscn3Q9QXW4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fscn3Q9QXW4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fscn3Q9QXW4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fscn3Q9QXW4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fscn3Q9QXW4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Fscn3Q9QXW4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms