Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Copg2Q9QXK3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Copg2Q9QXK3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms