Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tlr5Q9JLF7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms