Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gpa33Q9JKA5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms