Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Lmbr1Q9JIT0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Lmbr1Q9JIT0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms