Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnf138rt1Q9D9M9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms