Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Capns2Q9D7J7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms