Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Q9D7E4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms