Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3a3Q9D554 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sf3a3Q9D554 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms