Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snf8Q9CZ28 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms