Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ndufaf1Q9CWX2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ndufaf1Q9CWX2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufaf1Q9CWX2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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