Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Chchd5Q9CQP3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms