Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
1700029P11RikQ9CQ68 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms