Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Krt88Q9CPR6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Krt88Q9CPR6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms