Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim3Q99PE5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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