Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
4930550L24RikQ99PA7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4930550L24RikQ99PA7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms