Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tlr3Q99MB1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Tlr3Q99MB1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tlr3Q99MB1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms