Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp16Q99LG0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Usp16Q99LG0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms