Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Rnf144aQ925F3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf144aQ925F3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf144aQ925F3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf144aQ925F3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf144aQ925F3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Rnf144aQ925F3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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