Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sh3bgrl3Q91VW3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms