Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubxn4Q8VCH8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Ubxn4Q8VCH8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Ubxn4Q8VCH8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Ubxn4Q8VCH8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubxn4Q8VCH8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms