Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc12Q8R344 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc12Q8R344 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms