Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nup58Q8R332 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Nup58Q8R332 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Nup58Q8R332 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nup58Q8R332 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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