Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pacs1Q8K212 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pacs1Q8K212 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms