Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Tshz3Q8CGV9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Tshz3Q8CGV9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Tshz3Q8CGV9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Tshz3Q8CGV9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Tshz3Q8CGV9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tshz3Q8CGV9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms