Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Cdkl1Q8CEQ0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms