Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5C9

TPA-induced transmembrane protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C5C9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q8C5C9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8C5C9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q8C5C9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms