Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trerf1Q8BXJ2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms