Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18l1Q8BW22 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ss18l1Q8BW22 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ss18l1Q8BW22 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ss18l1Q8BW22 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ss18l1Q8BW22 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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