Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cops7bQ8BV13 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cops7bQ8BV13 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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