Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nop53Q8BK35 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nop53Q8BK35 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms