Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmco3Q8BH01 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms