Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Ubash3bQ8BGG7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Ubash3bQ8BGG7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms