Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim6Q8BGE7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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